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IGV 使用指南 | 在Linux上生成基因组可视化图

IGV (Itegrative Genomics Viewer)是一款功能强大的综合性基因组学可视化工具,能够将基因组的变异情况进行可视化,因此广泛应用于基因组学的研究中。IGV有着良好的图形界面,在window系统上操作十分便利。然而,当我们需要批量处理生信数据时,Linux系统是一个更好的选择。不幸的是,IGV在Linux上的使用并不友好。本文记录了在Linux上使用IGV的具体方法。

AnnotSV Singularity容器

AnnotSV 是一个功能强大的开源软件和在线工具,专门用于对人类基因组中的结构变异进行注释和优先排序。由于 AnnotSV 安装有点麻烦,所以封装了一个包含 AnnotSV 的 Singularity 容器,便于直接使用。

Crontab 定时任务指南 | Linux 系统自动化操作教程

计划任务(Crontab)是指在Linux系统中,利用cron(crond)这个系统服务来控制的定时执行工具,它允许用户创建和管理计划任务,以便在特定的时间间隔或时间点自动运行命令或脚本。Crontab是cron table的缩写,其中cron是Unix系统中的一个后台进程,用于执行预定的任务。Crontab文件包含一系列计划任务条目,每个条目都定义了一个任务的执行时间和要运行的命令或脚本。这些任务可以按照分钟、小时、日、月和星期等不同的时间单位进行安排。